Philipp Korber

Die Positionierung und Umgestaltung von Nuklesomen in Hefen

Ein Großteil der eukaryotischen Kern-DNA ist in Nukleosomen organisiert, die nicht zufällig verteilt sind, sondern in Bezug auf die DNA-Sequenz definierte Positionen einnehmen. Diese Nukleosomenpositionierung ist für alle genomischen Prozesse von grundlegender Bedeutung, da sie die Zugänglichkeit der DNA reguliert. So kann sich beispielsweise eine Bindungsstelle für einen Transkriptionsfaktor in einer nukleosomenfreien Region befinden und in einer Zelle leicht von dem entsprechenden Faktor gebunden werden, während sie in einer anderen Zelle in ein Nukleosom eingebunden und daher unzugänglich ist. Wir möchten verstehen, welche Faktoren die Nukleosomenpositionierung bestimmen, insbesondere wie die DNA-Sequenz ausgelesen und in die Nukleosomenpositionierung übersetzt wird und wie positionierte Nukleosomen in einem biologischen Zustand in einem anderen Zustand zu einer veränderten Organisation umgestaltet werden. Dies ist beispielsweise in Promotorregionen relevant, wo die Nukleosomenorganisation die Transkriptionsaktivität anregt oder unterdrückt. Wir verwenden die einzelligen Hefen Saccharomyces cerevisiae und Schizosaccharomyces pombe als In-vivo- und In-vitro-Modelle. Als unser Spezialgebiet haben wir das erste genomweite Rekonstitutionssystem etabliert, das die biochemische Charakterisierung von Faktoren und deren Mechanismen bei der Nukleosomenpositionierung und -umgestaltung ermöglicht.

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